Не верю! (с) Изложите вашу версию от начала до конца!
Излагаю:
Есть домен old.local, в нем толпа пользователей и компьютеров. Делаем новый домен в новом лесу - new.local. Большую часть компьютеров мигрируем с помощью утилиты от M$.
Все пользователя домена мигрируются с помощью той же утилиты.
Оставшуюся часть компьютеров переносим руками следующим образом: делаем пользователя (который работает на этом компьютере) локальным администратором. Логинимся под ним. Вводим компьютер в новый домен (не выводим/вводим, а именно сразу меняем имя домена в свойствах "Мой компьютер"), после ребута опять логинимся под этим же пользователем в новый домен -> профиль мигрирует -> профит!
PS: У пользователя получается две почти одинаковые папки в Docs & Settings: username и username.new.
PPS: Для Win 7 & Vista делать пользователя локальным админом необязательно.